Das ist schwer. Ein "versauter" Ton wird auch so aufgenommen.
(Rein theoretisch: Du musst das Signal splitten und einmal direkt aufnehmen und ein zweites Signal mit dem Effekt auf einer anderen Spur aufnehmen und das trockene Signal für den Monitor stumm schalten... Es geht, ist aber viel Aufwand, der meistens nichts bringt. Wenn Deine Effekte Zeit verbraten, dann musst Du auch für das trockene Signal Zeit verbraten, sonst wird das asynchron.)


Wenn Du Effekte brauchst, dann nimm alles ohne Effekte auf und füge die Effekte später dazu. Für die Effekte ist es erstmal egal, ob das Signal von der Gitarre oder von der Festplatte kommt.


Desktop; i7-2600k, 8 GB mem., Win 10 Pro, BIAB 2017; RB 2017 - latest build
Laptop: i5-2410M, 4 GB mem, Win 10 Pro, BIAB 2017; RB 2017 - latest build