Je ne sais pas si cela peut aider, mais j'ai eu (et ai de temps en temps) le même problème, sur la base de ma configuration...
(Interface Line 6 UX2 + Ketron SD 2).
Le midi fonctionne bien avec le synthé interne (Coyote Forte) mais quand on le déactive (et de ce fait enclenche le SD2)le son des instruments est "mélangé" avec des sons "parasites" qui n'ont rien à voir avec le morceau.
J'ai résolu le problème, mais ne sais pas exactement comment!!!!
En fait, j'ai supprimé un nombre d'options qui étaient cochées dans l'onglet "Midi-Audio driver setup", puis "Audio settings", dans la colonne de gauche... Je sais, c'est un peu imprécis, il faut tout essayer...
Courage!
Bernard