Non ci sono problemi, io lo utilizzo proprio in questo modo su un mio HD USB esterno.
BIAB non è un programma che si installa, almeno nel significato che si da normalmente all'installazione in ambiente Windows.
La cartella che contiene il programma bb.exe e tutti gli stili, song, etc.. è autosufficiente e il programma parte da qualsiasi posizione di memoria di massa.
Sono quasi sicuro di averlo utilizzato anche da un HD in rete.